Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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