Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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