Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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