Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
SPTAN1Q13813 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SPTAN1Q13813 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms