Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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