Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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