Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
TCOF1Q13428 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TCOF1Q13428 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms