Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
AP3B2Q13367 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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