Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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CLN3Q13286 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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CLN3Q13286 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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CLN3Q13286 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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CLN3Q13286 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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