Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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CALCOCO2Q13137 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CALCOCO2Q13137 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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