Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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