Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms