Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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