Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRDNQ13061 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms