Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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GRIK3Q13003 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK3Q13003 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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