Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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