Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GTF3C1Q12789 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GTF3C1Q12789 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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