Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERFP50548 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERFP50548 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERFP50548 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms