Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CASQ1P31415 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CASQ1P31415 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms