Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRMP28827 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRMP28827 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRMP28827 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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PTPRMP28827 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRMP28827 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRMP28827 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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PTPRMP28827 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRMP28827 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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PTPRMP28827 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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PTPRMP28827 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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PTPRMP28827 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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PTPRMP28827 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRMP28827 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRMP28827 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPRMP28827 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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