Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATG7O95352 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ATG7O95352 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ATG7O95352 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms