Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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