Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBXN4Q92575 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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