Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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