Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PTPRNQ16849 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRNQ16849 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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