Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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LAMA3Q16787 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAMA3Q16787 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAMA3Q16787 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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