Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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