Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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RYR3Q15413 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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RYR3Q15413 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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RYR3Q15413 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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RYR3Q15413 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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RYR3Q15413 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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RYR3Q15413 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RYR3Q15413 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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