Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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