Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRKQ15262 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRKQ15262 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms