Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PCOLCEQ15113 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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