Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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