Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHPRHQ149N8 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SHPRHQ149N8 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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