Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE4AQ14139 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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UBE4AQ14139 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
UBE4AQ14139 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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