Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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PDE6HQ13956 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE6HQ13956 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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