Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms