Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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FOXE3Q13461 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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FOXE3Q13461 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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FOXE3Q13461 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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FOXE3Q13461 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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FOXE3Q13461 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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FOXE3Q13461 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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