Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SF3B2Q13435 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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