Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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ITGB3BPQ13352 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BPQ13352 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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