Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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