Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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KCNMA1Q12791 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNMA1Q12791 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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