Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPRDP23468 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRDP23468 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRDP23468 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRDP23468 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPRDP23468 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
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