Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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