Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MTSS1O43312 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
MTSS1O43312 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
MTSS1O43312 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MTSS1O43312 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
MTSS1O43312 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MTSS1O43312 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MTSS1O43312 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MTSS1O43312 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MTSS1O43312 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
MTSS1O43312 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms