Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
J3KRW8 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
J3KRW8 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
J3KRW8 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
J3KRW8 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
J3KRW8 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
J3KRW8 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
J3KRW8 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
J3KRW8 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms