Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms