Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRPF3Q9ULD4 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms