Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TIMMDC1Q9NPL8 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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