Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXQ1Q9C009 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms