Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RNF17Q9BXT8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RNF17Q9BXT8 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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